Permesso non retribuito (Anno di prova, fase B)

Un insegnante assunto in fase B ma titolare di una supplenza fino al 30/06/2016 risulta assunto giuridicamente fino al 30/06/2016 ed economicamente dal 01/07/2016. Questo è assodato. Può svolgere l'anno di prova utilizzando il contratto a tempo determinato, anche questo è assodato.
La domanda è: nel momento in cui l'insegnante necessita di un permesso non retribuito (che pare spezzare la carriera dividendo in due o più tronconi il servizio svolto) ci sono problemi per quanto riguarda il regolare svolgimento dell'anno di prova? o basta semplicemente che ci siano i famosi 180 giorni durante l'anno scolastico? In seguito ci saranno problemi per la ricostruzione della carriera?
Grazie!

bastano i 180 gg, anche per la ricostruzione di carriera