Risvolti legali - sostituzioni e firma sul registro elettronico

Ho un dubbio per quanto riguarda le sostituzioni. Nella mia scuola ci sono classi articolate (due sezioni con indirizzi diversi nella stessa classe) che hanno materie in comune e ore in cui i diversi indirizzi di studio seguono lezioni con docenti diversi. La mia materia riguarda solo parte della classe. Quando manca il docente dell'altra sezione mi mettono in sostituzione per l'altra metà della classe che non è mia. Il mio dubbio è: se ho già una lezione in orario e firmo il registro elettronico per la mia sezione il registro non mi fa firmare più per l'altra sezione. Ciò significa che non posso fare l'appello, non posso segnare uscite anticipate, note ecc. Non firmando il registro elettronico, legalmente non ho fatto la sostituzione. Allora mi domando, forse è 'illegale' in partenza dare una sostituzione quando si ha già una lezione regolarmente in orario? In questi casi devo rifiutare la sostituzione oppure è solo un problema tecico del registro elettronico che va sistemato (il registro prevede la compresenza di docenti ma non la compresenza di classi)?